La Junta Ejecutiva Central, compuesta por distintas Secretarías, es la conducción ejecutiva del sindicato y su función radica en dirigir, administrar y representar a la UEPC. La Junta Ejecutiva es el órgano que ejecuta las decisiones que se adoptan a través de la autoridad máxima: la Asamblea Provincial de Delegados Departamentales. En la Asamblea Departamental reside la soberanía de la UEPC y está compuesta por delegadas y delegados que representan a la totalidad de los departamentos que conforman la provincia de Córdoba.